女孩子腰疼原因主要有以下幾方面：1、腰部外傷：腰部肌肉扭傷、腰部肌肉勞損、腰間盤突出、椎體以及肋骨骨折導致出現腰疼癥狀；2、代謝系統疾病：青春期女孩甲狀腺功能亢進，長期低鈣飲食，不曬太陽導致骨質疏松表現為腰部疼痛；3、風濕免疫性疾病：強直性脊柱炎、系統性紅斑狼瘡、風濕性關節炎、類風濕關節炎表現為腰部疼痛，同時伴有發熱、尿常規改變等癥狀，及時到醫院進行風濕免疫相關檢查，指標可能有所異常；4、惡性疾病：脊柱結核、膀胱占位、腎臟占位導致出現腰疼癥狀；5、泌尿系統疾病：膀胱炎、腎結石、輸尿管結石表現為腰部疼痛；6、月經期：年長女孩子處于月經期以及月經前期，也可出現一過性腰疼癥狀。