目前對于病毒性腦脊髓炎首先需進行抗病毒治療，臨床常見阿昔洛韋、更昔洛韋等抗病毒藥物治療。其次需依靠自身免疫力清除體內病毒，當病毒積聚量較大時，可誘發機體產生免疫反應，此類患者若誘發自身免疫性抗體出現時可加重病情。必要時醫生需進行進行腰穿檢查，將腰穿標本腦脊液進行抗體細胞檢測，從而針對性加入免疫治療如激素和丙種球蛋白等。 病毒性腦脊髓炎一般為外界環境病毒或自身潛在病毒在機體抵抗力減弱情況下侵入中樞神經系統，包括腦和脊髓，在腦脊液中進行循環、繁殖，造成腦和脊髓損害。