足部囊腫分沒有癥狀且生長緩慢，以及存在癥狀的囊腫，形成通常與活動過多有關，由于關節或肌腱表面反復摩擦，出現薄弱點，使得囊液在局部積聚，逐漸加重所致。所以對沒有癥狀、生長速度較緩慢的囊腫，可以暫時不予處理，以休息為主，減少活動或采取制動方式，使得囊腫生長速度下降。囊腫不是腫瘤，只是薄弱，內部包括滑液和關節液體，所以并不會惡變。囊腫生長過大，或某些部位囊腫出現壓迫癥狀，主要是在內踝的踝管部位，囊腫壓迫走行的神經和血管，出現足底麻木、疼痛不適，存在癥狀且神經功能損傷。此時需要及時去除踝管壓迫和神經受壓，主要采用手術切除方式，但注意將囊腫、相連囊壁和結締部結構充分切除，才能避免復發，同時注意避免傷及重要神經、血管、肌腱等組織。部分患者會對部分囊腫進行按壓，使其破損，但由于囊壁愈合后，囊腫會重新生長，所以并不建議對不明原因的囊腫進行按壓。也有患者采用囊腫抽吸方式，通過注射藥物封閉，但也有一定風險，包括囊腫再發，注射到囊壁外出現組織損傷等。所以對于囊腫，需要到專科醫院進行檢查和治療，才較安全和有效。