在發生咽喉部感染時會出現咽喉炎癥，這時有時需要應用抗生素來治療。由于咽喉部大量的細菌屬于桿菌或鏈球菌，因此對頭孢類藥物和青霉素類藥物相對比較敏感，在出現細菌感染的咽喉炎癥時，可以用頭孢類抗生素和青霉素類抗生素來治療。大部分上呼吸道感染，包括鼻炎、咽炎和喉炎都是由病毒感染所導致。因此大部分病人在出現上呼吸道感染之后，不需要大量應用抗生素，而只需要對癥治療，可以先休息，多飲水，注意保暖。很多病人隨著病程進展，一般在7天癥狀就會自愈。因為大部分病人的上呼吸道感染是病毒感染所導致，而只有少部分細菌感染的病人，可能會出現咽喉部炎癥不容易痊愈，這時可以給予一定程度的抗生素。如果部分病人對頭孢類或者是青霉素類抗生素過敏，也可以選取大環內酯類抗生素。由于咽喉部感染通常并非非常特異性感染，因此普通的廣譜抗生素即可達到治療目的。