活躍的精子只有在顯微鏡下才能看得到，通常是相對無色透明的。我們看到的只是精液顏色，大部分把它描述成灰白色，如果近期1個星期之內同房3-4次，精液會變得更稀、更白，這是相對正常的現象。如果長達3-4周一直在禁欲，沒有排精，精液的顏色可能會帶一點黃色，這也是正常的。如果精液變成了其他顏色，或者伴有臭味，很可能是細菌感染所致，最常見的疾病是前列腺炎和精囊炎，因為前列腺液占有整個精液的80%-90%以上，如果前列腺發炎，排出來精液的顏色、性狀都會有改變。在優生優育，還有男科學的檢查方面，精液的顏色只是作為參考，或者線索，更依賴于精液常規檢查，這樣能明確知道精子的數量有多少、有活力的精子占比有多少、精子的畸形度怎么樣，以及精液的pH值有無液化等情況，這樣更方便于臨床的診斷及治療。