腦積水根據成因不同也有不同的治療方法，主要有以下兩種：1、腦室腹腔分流術：將引流管一端放在顱內，另一端像魚缸換水一樣塞在腹腔里，在皮下走行分流管，達到閉合的效果，讓大腦分泌出的多余的腦脊液通過引流管引入腹腔，通過腹膜大面積的半透膜來吸收。這種治療方法適合于各種腦積水的治療，但也有弊病，即在早期兩年之內發生堵管、感染、排異的比率在40%左右。現在隨著技術的不斷完善，引流管材質也在不斷改善，包括用抗生素浸泡的引流管，但并發癥的發生率也在35%左右，兩年之后趨于穩定；2、內窺鏡第三腦室底造瘺術：適應癥比較窄，僅適用于機械性梗阻，即在腦室流出道最窄處，大概1.2mm左右的中腦導水管段如果出現炎癥的閉鎖、粘連，或者是腫瘤的生長壓迫導致閉鎖，腦脊液由于機械梗阻無法流出，引起腦室變大。可以通過內窺鏡第三腦室底造瘺改變流動出口，讓腦脊液從第三腦室底開口再回到腦表面進行循環。此手術的好處是不改變生理結構，并發癥少，但適應癥窄，只適用于梗阻性腦積水。