甲硝唑漱口水主要用于防治口腔感染，主要的有效成分是甲硝唑，甲硝唑屬于硝基咪唑類的抗菌藥物，主要是針對厭氧菌，具有強大的抗菌作用。甲硝唑發揮作用，主要是通過分子中所含有的硝基，能夠在無氧的條件下還原為具有細胞毒作用的基團，從而可以影響病原菌的代謝，起到抗菌的作用。因此甲硝唑發揮抗菌作用，需要在無氧條件下，針對厭氧菌具有強大的抗菌活性，比較適合用于口腔感染，主要是因厭氧菌比較容易誘發口腔感染。在臨床上，甲硝唑漱口水可以用于牙齦炎、牙周炎、冠周炎、牙槽膿腫等相關的口腔感染，起到抗菌、消毒的作用。此藥物是漱口水，含漱之后要把漱口水吐出，通常不建議患者吞下服用。