甲硝唑主要用于治療或預防厭氧菌引起的系統或局部感染，如腹腔、消化道、女性生殖器、下呼吸道、皮膚及軟組織、骨和關節等部位的厭氧菌感染。甲硝唑對敗血癥、心內膜炎、腦膜感染以及使用抗生素引起的結腸炎也有效。治療破傷風時常與破傷風抗毒素聯用，還用于治療口腔厭氧菌的感染。甲硝唑緩釋片用于厭氧菌、滴蟲、原蟲感染治療，與其它抗菌藥聯合應用于治療厭氧菌和非厭氧菌的混合感染。 甲硝唑緩釋片應在飯前1小時或飯后2小時空腹情況下整片吞服，空腹可保持本片最佳治療特性。