兒童再生障礙性貧血的預后與很多因素有關，包括臨床表現、臨床分型、骨髓衰竭程度以及所選擇的治療方法。目前由于對疾病的了解，預后越來越好，具體分析如下： 1、重型兒童再障：大部分患兒起病比較緩慢，臨床表現主要是貧血、出血和感染。嚴重出血的患者，尤其是顱內出血、嚴重消化道出血的患者，病死率相對較高； 2、輕型兒童再障：由于骨髓抑制程度比較輕，全血細胞減少的程度輕，病情相對較輕，大部分患者的預后比較良好。兒童患者藥物治療效果比成人要好，早治療比晚治療的效果要好，規范化治療比不規范化的治療效果要好。支持治療可以明顯改善患者體質，預防感染，減短病程，以及可以達到良好的效果； 3、致死性兒童再障：主要病因是嚴重感染以及顱內出血。一般治療得當，絕大部分患者可以完全治愈。目前由于移植技術改進，重型和極重型兒童再障的療效可以達到90%以上五年無病生存。