亞急性甲狀腺炎的病程會持續多久，每個患者不一樣，具體情況如下：1、2-3個月：一般亞急性甲狀腺炎的規范治療療程約是2-3個月，它的特效治療藥物是潑尼松，對于這種藥物的應用，應該要嚴格的按照醫生的指導進行，因為部分些患者吃藥以后立馬不痛，認為自己病好，就把潑尼松迅速停掉，停后有可能會導致疾病又再次反彈加重，所以對于潑尼松藥物的應用應該逐漸減量，并且要在醫生的指導下逐漸減量；2、0.5-1年：有些人群患一次亞急性甲狀腺炎以后有可能會反復的再犯，甚至會持續0.5-1年之久，對于這種情況，可能是由于患者經常感冒，因為亞急性甲狀腺炎目前的病因和病毒感染有一定關系，所以如果不想自己的亞急性甲狀腺炎再反復發作，建議患者適當的進行體育鍛煉，并且盡可能的少感冒，才有可能減少亞急性甲狀腺炎的發作次數。