注射宮頸癌疫苗不會影響月經，因為疫苗注射在人體內只會引起免疫應答反應，產生抗體，對以后發生HPV感染入侵時，會阻止進一步感染。月經形成與卵巢功能、雌激素分泌有關，因此注射HPV疫苗不可能影響到卵巢的激素水平功能，不會影響月經。 研究發現，注射HPV疫苗對于后續懷孕、妊娠以及生產沒有明顯影響，不會增加流產風險。注射HPV疫苗唯一的不良反應，會有少數女性出現發熱，與兒童注射預防接種疫苗有類似的不良反應。