真菌感染為微生物感染，需尋找真菌感染的原因及真菌類型，采取相應治療措施，可達到臨床治愈。 真菌感染相對較好治，臨床存在多種抗真菌藥物。明確真菌感染后，可給予常用的抗真菌藥治療。但若常見抗真菌藥效果不佳，可能為出現真菌耐藥性，可進行藥物敏感實驗，選用敏感的抗真菌藥物治療。 除進行抗真菌治療外，應尋找真菌感染的原因。真菌感染又稱機會性感染或條件性感染，即念珠菌或真菌之所以能夠感染，證明患者身體條件適合其生長，如存在貧血、戴假牙、口干、血糖高，均為真菌感染的條件。若存在類似引起真菌感染的誘因，除進行抗真菌治療外，還需糾正真菌感染的誘因，才可完全治好真菌感染。