引起眼睛真菌性感染的情況比較復雜，因為有不同的部位、不同的感染機制。比較常見的眼瞼的真菌感染，就是真菌性皮膚病。另外一個比較常見的，就是真菌性角膜炎，真菌性角膜炎一般伴隨眼外傷，有角膜的劃傷，最常見的包括樹枝、谷物秸稈等劃傷，造成角膜損傷，還附著大量真菌，使真菌趁虛而入，引起真菌性角膜炎。還有一些特殊患者，比如長期應用抗生素，造成菌群失調，可能還會引起內源性真菌感染，這種內源性真菌感染，會隨著血液循環到達眼內，引起真菌性的眼內炎。?因此，眼睛真菌感染可能是眼睛表面的皮膚問題，也可能是眼睛角膜的問題，還有可能是眼內的感染。有外源性的途徑，如外源的接觸、外傷，還有內源性的途徑，即沒有受傷，通過血液循環引起。總而言之，真菌性的炎癥，不管是真菌性角膜炎還是真菌性眼內炎，治療都是非常棘手。因為治療真菌，沒有特別好的藥物，而且不管得了真菌性的角膜炎還是眼內炎，往往有身體局部和全身的特殊病理狀態，患病后治療非常復雜，患者要堅持跟醫生配合治療。