甲狀腺濾泡囊腫一般不會自愈，通過干預、手術以后才可能治愈。甲狀腺結節有良性結節和惡性結節，可以通過超聲檢查判斷性質，不管是良性，還是惡性，都不會自愈。如果甲狀腺囊腫里的液體能吸收，可能會自愈，其他濾泡結節或者一般結節需要干預之后才可能消失，不可能自行消失。 甲狀腺濾泡囊腫干預包括口服藥物，如中藥，散結化瘀的中藥對小結節可能有作用，甚至有時可能使小結節消失，但是對大的結節一般治療較困難。