做腸鏡不會對身體產生較大傷害，但腸鏡畢竟屬于有創檢查，可能會存在一定的風險或并發癥。做腸鏡檢查前需要服用瀉藥，使腸道處于清潔狀態，才能做腸鏡檢查，而大量飲用此類藥物可能會造成人體電解質紊亂，并且大量排泄對于原有心腦血管疾病的患者可能會存在一定的風險。腸鏡檢查時需要將腸鏡從肛門塞入腸腔，完整地對整個結腸進行觀察，而對于有過腹部手術史或存在腸粘連的患者，檢查時更容易出現腸道穿孔、腸黏膜損傷。如果在病變時，對病變部位進行活檢，可能會引起出血。因此，做腸鏡對正常人的身體沒有較大影響，但對于患有相關基礎疾病的患者而言，不管是腸道準備，還是腸鏡檢查本身，都可能會存在一定的風險。