有一部分病毒感染有特效的抗病毒藥物，有一部分病毒感染缺乏特效的抗病毒藥物治療。臨床上比較常見的有抗病毒藥物的病毒感染，一般包括以下幾類，所用的藥物一般有所不同：1、流感病毒感染：一般常用神經氨酸酶抑制劑，可以應用奧司他韋、帕拉米韋和扎那米韋；2、單純皰疹病毒Ⅰ型、Ⅱ型以及水痘-帶狀皰疹病毒感染：一般首選阿昔洛韋，也可以應用泛昔洛韋，或者伐昔洛韋。如果阿昔洛韋耐藥，也可以應用膦甲酸鈉；3、EB病毒感染：一般可以應用干擾素，阿昔洛韋、更昔洛韋的治療效果不好；4、巨細胞病毒感染：一般首選更昔洛韋，也可以口服纈更昔洛韋。如果更昔洛韋耐藥，一般會選擇膦甲酸鈉；5、乙肝病毒感染：一般常用核苷類的或者核苷酸類的抑制物，也可以應用干擾素，兩者可以單獨應用，也可以聯合應用；6、丙肝病毒感染：一般應用小分子蛋白酶抑制劑、聚合酶的核苷類，或者非核苷類的抑制劑，也可以應用干擾素和利巴韋林，利巴韋林一般不單獨使用，需要聯合用藥；7、艾滋病毒感染：也就是人類免疫缺陷病毒感染，一般需要應用核苷類的或者非核苷類的逆轉錄酶抑制劑，或者整合酶的抑制劑。