眼部潰瘍多見于結膜潰瘍和角膜潰瘍，結膜潰瘍要根據病因對癥治療，如感染引起或免疫相關因素引起，需要抗感染治療或局部抗炎治療。較嚴重的潰瘍可能需要做結膜移植手術或羊膜移植手術，促進潰瘍愈合。 角膜潰瘍主要是針對引起角膜潰瘍的病因進行治療，感染性角膜潰瘍要積極抗感染治療，但是對于病變較嚴重、病灶較深、即將發生角膜穿孔的患者，可能需手術干預，進行病灶切除，聯合板層角膜移植，聯合羊膜移植手術或進行結膜瓣遮蓋手術，都是可促進潰瘍愈合的方法。此外，如免疫相關疾病，類風濕關節炎也易出現角膜潰瘍，局部可能需要使用免疫抑制劑，或有時需應用激素抗炎，還要針對全身疾病進行治療。