內囊位于尾狀核、豆狀核和丘腦之間，內囊的前側是尾狀核、外側是豆狀核、內側是丘腦。內囊是走行的白質纖維，不同的部位，功能也不盡相同。內囊的膝部主要是皮質核束，與面部的運動相關，內囊的后肢是皮質脊髓束，與肢體的運動相關。此外，內囊的后肢還有視輻射和聽輻射。內囊盡管所占面積不大，但內囊的白質纖維走行比較密集，若內囊出現病變，可能會對身體的功能造成比較大的影響。如果是腦梗塞或者出血，累及內囊部位，盡管病灶比較小，可能會對運動系統造成較大影響，可能會出現肢體的偏癱、偏盲、偏深感覺障礙，也就是內囊病變的三偏綜合征。