一般腸鏡檢查時間包括進鏡時間和退鏡時間，進鏡時間會較快，退鏡要求至少在6分鐘以上，對發現結腸息肉等病變會有幫助。通常無痛腸鏡過程包括麻醉過程、檢查過程、退鏡過程，一般檢查需要10-15分鐘。 腸鏡檢查是有創檢查，現在有較多醫院都會采取無痛苦腸鏡檢查，即在全身麻醉狀態下進行腸鏡檢查。麻醉狀態下，因為患者沒有痛苦，也不會有任何感覺，所以對患者是較舒服的一種方式。 但是因為患者沒有痛苦，沒有任何反應，對操作者的要求也相對較高。操作熟練的、有經驗的操作醫生檢查，包括腸鏡檢查時間，肯定會跟普通腸鏡檢查一樣較順利。根據不同人群，比如有腹部手術病史，或者其它腹部疾病，其難易程度也不同。