咀嚼時耳根疼痛，主要有兩種主要原因，具體內容如下：1、下頜關節炎癥：即下頜關節炎，當下頜關節發生無菌性的炎癥或者是急性化膿性炎癥時，則會出現咀嚼時耳痛以及面部的疼痛。主要的原因為經常咀嚼較硬食物或者由于咬合關系不好所造成的下頜關節的炎癥，主要的治療辦法為減少咀嚼過硬飲食，同時不能過度使用下頜關節，給予局部的抗炎軟膏涂抹；2、下咽部腫瘤：即下咽癌，下咽癌為下咽部惡性腫瘤，出現咀嚼時放射性耳痛，其他癥狀還包括吞咽疼痛、吞咽不適以及進食困難等，晚期還會出現頸部淋巴結轉移。