在脊膜膨出進行手術以后，大部分的患者可能會有一個比較好的治療效果。但是根據手術的時機，還有脊膜膨出的炎癥程度，可能也會留有一定的后遺癥，具體后遺癥有以下幾點：1、如果一部分脊膜膨出手術時機相對選擇偏晚，病人因為年齡偏大，同時合并有其他的畸形，這些畸形會作為后遺癥遺落下來。比如有些脊膜膨出的患兒，可能會出現脊柱發育的畸形，出現脊柱側彎，有些甚至可以出現雙下肢的長度不等，即使做了手術以后，仍然無法得到很好的糾正，就是一種后遺癥；2、有些患兒因為在手術的過程當中，發現脂肪瘤或者病灶組織，和神經的粘連過于緊密，術前神經已經受到膨出壓迫，發生了變性。此時即使經過后期的手術，也可能會出現膀胱機能不全，還有腸道功能不全的后遺癥。表現為壓力性膀胱、膀胱過于龐大，每次接小便的量很少，但是在膀胱里蓄積的尿液卻很多。也有部分就是表現為腸道的擴大，表現為巨結腸、便秘。也有一部分表現為腹瀉等，都是比較常見的手術后的后遺癥。