多囊腎引起高血壓的治療最關鍵的是降壓治療，血壓下降后，可以減少多囊腎對于腎功能的影響。通常多囊腎的發展病程無法延緩，較多的多囊腎患者在臨床上隨著病程延長，多囊的情況會加重，以及逐漸壓迫有效的腎單位，使血肌酐的水平逐漸升高。部分年輕的腎尿毒癥患者可能因為多囊腎引起的高血壓，同時加重腎損害，因此患者的血壓管理較為關鍵。用藥方面以鈣離子拮抗劑為主，即地平類的降壓藥物，還可以進行不同種類的地平類聯合，如目前常用的氨氯地平、硝苯地平、拉西地平、非洛地平等。如果無法較好的控制病情，可以根據患者心跳的情況加用藥物，如果心率增快，可以加用β受體阻斷劑或后期加用α受體阻斷劑或者α、β受體復方的阻滯劑。另外，還應根據患者腎功能，必要時可以加入利尿的降壓藥物，早期患者的肌酐水平正常時，可以謹慎使用RAS系統阻滯劑，如沙坦類的或普利類藥物。但患者在用藥過程中，應注意監測血肌酐的水平，如果發現血肌酐的明顯升高，應盡量慎用或減少應用的劑量。