男童排尿就疼的主要原因有以下幾種：1、包皮龜頭炎：要觀察陰莖外觀有無異常，如果發現包皮外口有腫脹和紅腫，可能是由于包皮垢引起的包皮龜頭炎。可以在家進行局部泡洗，鼓勵男童多飲水、多排尿，經過3-5天的泡洗，癥狀就會自然好轉；2、泌尿系統感染：多伴有尿頻、尿急、尿痛的癥狀，檢查方式也非常簡單，到醫院檢查尿常規就可以非常準確地判斷。如果合并有泌尿系感染，需要進行抗感染治療，可能需要口服一段時間的抗生素，這期間也需要多飲水、多排尿；3、泌尿系統結石：也是男童排尿疼的高發原因，此時需要進行相關檢查，如泌尿系統超聲檢查、泌尿系統X線檢查，了解有無泌尿系結石。較小的結石可以自行保守治療排出，如果結石較大可能需要手術治療。