第三代的頭孢菌素常用的是頭孢克肟、頭孢噻肟，以及頭孢曲松類藥物。頭孢菌素分成五代，一代現在較少使用，市面上常用的是二代和三代，二代和三代的特點是皆增加對革蘭氏陰性菌的作用。四代、五代不光對于革蘭氏陰性菌及革蘭氏陽性菌的抗菌作用強，同時腎毒性、副作用較小，是更為高級的頭孢菌素。臨床上常用的能夠控制多數疾病的是二代和三代，三代用得較多，如常見的頭孢曲松、頭孢克肟，皆是第三代頭孢菌素。不同廠家的藥物，商品名不同，所以買藥時應注意區分。三代頭孢的主要特點就是抗菌譜比以前的頭孢菌素更為廣泛，也能夠控制目前多數婦科感染以及呼吸道的感染，而且副作用也并不大。