建議飯后30分鐘內服用氨糖軟骨素，效果相對較好，還能有效避免產生不良消化道癥狀。此時服用會使藥物與食物混合在一起，減少藥物與胃黏膜的接觸面積和接觸時間，可促進藥物吸收，并減少藥物對胃腸黏膜產生不良影響，如胃部疼痛甚至胃黏膜炎癥。該藥短期內服用可有輕度癥狀，長時間服用易導致胃部炎癥改變，可使胃黏膜的功能嚴重受損。氨糖軟骨素對于患有關節炎癥、關節損傷等疾病的患者，是比較重要的輔助性藥物，如果長時間服用，有利于關節軟骨修復，保留關節功能。但在服用期間要嚴格保護胃腸道黏膜，避免因治療關節疾病而產生消化系統癥狀。