全身神經痛的原因，可能是神經肌肉疾病引起，如多發性肌炎會出現全身神經痛的癥狀。還有周圍神經病變，包括電解質紊亂引起的周圍神經病變，或者是電解質紊亂本身也會出現全身神經痛的癥狀。糖尿病引起的周圍神經病變，以及長期喝酒慢性酒精中毒，也會引起全身神經痛的癥狀。維生素B1缺乏，維生素B12缺乏，都會引起周圍神經炎癥，全身神經痛的癥狀。自身免疫性的周圍神經炎癥，也會導致全身神經痛的癥狀。神經壓迫也會引起此類情況，還有全身性疾病，包括骨質疏松、血鈣降低，會引起全身神經痛的癥狀，可以通過補充降鈣素改善血鈣，進而改善癥狀。還有低血糖、貧血、電解質紊亂，會出現全身神經痛的癥狀。大腦的缺血、缺氧，導致全身神經痛，神經功能下降引起的癥狀。還有心理精神疾病也會表現出全身神經痛。通過檢查不存在神經的問題，焦慮癥、抑郁癥、精神分裂癥，都可以表現出全身神經痛的癥狀。