輕癥先天性膈疝的存活率約在90%以上，通常預后較好。但如果是重癥先天性膈疝，存活率可能不到50%，通常死亡率較高。先天性膈疝的形成，是由于先天因素，在胚胎發育時，胸腔和腹腔之間的一層膜沒有完全長好，形成破損，腹腔里的臟器就會跑到胸腔內，壓迫肺臟、心臟。進入胸腔的臟器可以是肝臟、胃、腸等，壓迫肺臟就會引起新生兒缺氧，壓迫心臟就會導致缺血。如果發現先天性膈疝，要盡快進行手術矯正，將進入胸腔的臟器給復位到腹腔。隨后通過手術修補缺損的隔膜，在胸腔里放置一根胸腔閉式引流管。對于輕癥先天性膈疝，通常預后較好，而如果是重癥先天性膈疝，通常都沒有等到手術，新生兒就因缺血、缺氧而死亡。