殘端痛的治療可以使用神經病理性疼痛藥物，如卡馬西平、普瑞巴林、加巴噴丁等藥物。也可以在超聲引導下找到神經假瘤的位置，在神經假瘤的位置進行神經阻滯，緩解患者疼痛，如果患者疼痛沒有明顯好轉，還可以通過射頻毀損神經假瘤。 如果上述治療效果都不好，可以考慮外科手術切除神經假瘤，緩解患者殘端痛。還可以通過物理療法或者經皮電刺激、熱療，冷療緩解殘端痛。