梅杰綜合征并非不治之癥，可以通過藥物及手術進行治療。輕癥患者可以口服藥物治療，如安坦、巴氯芬、氟哌啶醇、氯硝西泮等藥物。 藥物控制效果不佳時可采用肉毒毒素注射治療，肉毒毒素可麻痹神經肌肉接頭，注射后患者可出現輕度面癱，但患者的眼瞼痙攣和口、下頜肌張力障礙可以得到有效控制。 部分患者注射肉毒毒素后可能發生過敏或療效不佳等情況，此時可以采用外科手術治療，如腦深部電刺激。經驗較豐富的神經外科醫生通過準確靶點植入治療梅杰綜合征，患者術后癥狀可明顯改善，且療效較為持久。