鑒別兩個疾病，通常是從臨床表現和病因進行鑒別。首先是四環素牙，一個病因是母親在妊娠期間長期或大量服用了四環素類的藥物，或者學齡前的兒童7歲之前長期或大量服用四環素類藥物，導致牙齒發育性改變。臨床表現主要為牙本質染色，后期通過陽光照射會逐漸變成棕褐色、褐色，比較嚴重的情況下會有牙齒缺損，前牙比后牙稍微嚴重一些。 其次是氟斑牙，有地區流行性，通常生活在高氟區，主要針對7歲之前的學齡前兒童。牙齒也多表現為多顆牙齒出現白堊色斑塊、白斑狀或者斑塊，有時候會有色素沉著；嚴重的情況下也會有凹陷、缺損的改變，還可能出現全身慢性氟中毒的表現，比如多關節病變。主要是通過病因和臨床表現，對四環素牙和氟斑牙進行鑒別診斷，從而指導臨床治療。