免疫系統疾病又稱為自身免疫性疾病，主要包括兩類，一類是器官特異性的自身免疫病，一類是器官非特性的自身免疫病。在臨床上把器官特異性自身免疫病常常稱為風濕病，例如系統性紅斑狼瘡、類風濕關節炎、干燥綜合征、皮肌炎、硬皮病、強直性脊柱炎等，器官非特異性的自身免疫病包括自身免疫性溶血性貧血、免疫性血小板減少、自身免疫性的肝病、甲狀腺炎、甲狀腺功能低下、橋本氏病等。自身免疫性疾病有相當多的種類，主要是由免疫調節功能的障礙、免疫調節的異常所引起。除此之外還有免疫缺陷性疾病、免疫增值性疾病等，所以免疫系統疾病是多種疾病。當出現免疫系統異常時一定到醫院請專科大夫進行診治，進行相關的檢查才能明確診斷，只有明確診斷才能進行規范治療。