暴發型流行性腦脊髓膜炎是臨床上的重癥、急癥，致死率較高。暴發型流行性腦脊髓膜炎首選的藥物是抗生素治療，具體選擇的抗生素需要根據疾病的致病菌區分，最常見的是腦膜炎雙球菌感染，同時也有奈瑟菌感染引發的暴發型流行性腦脊髓膜炎。腦膜炎雙球菌通常對于青霉素比較敏感，在基層醫院可以考慮選擇大劑量的青霉素劑進行治療。但是由于青霉素透過血-腦屏障能力較弱，而且目前耐藥現象不容忽視，所以也可以考慮應用三代頭孢菌素。尤其是透過血-腦屏障較好的抗生素，包括頭孢曲松、頭孢噻肟鈉及頭孢他啶。至于奈瑟菌感染，其治療的原則和雙球菌差不多，也是選擇青霉素劑和頭孢三代進行治療。根據治療的反應再調整抗生素，如果用青霉素劑或者三代頭孢就能控制住，就不需要再往上升級。但是臨床中也能見到應用了上述藥物之后反應不佳、應答不好的患者，則需要根據血培養、藥敏的結果，再選擇較高等的抗生素，也是合理的選擇。比如可以考慮應用碳青霉烯類以及其他類型的抗生素。而且需要多學科會診，根據藥敏的結果，根據致病菌對于抗生素的反應性，進行綜合調整。