鼻咽癌好發于鼻咽部，即鼻腔、口腔、咽腔之間，較為隱蔽，容量約15-30ml，其特別好發于鼻咽部的咽隱窩或咽后壁，此處在所有癌癥中最為隱蔽，故決定了鼻咽癌的特點，正常人通常無法觀察到，只有鼻咽鏡或影像學檢查方可觀察到此部位。 此部位位于顱底，距離大腦、頸內動脈、咽隱窩、鼻腔和咽腔均比較近，故發病時不易被發現，且容易在另一個解剖區域出現癥狀，其最大特點是易被漏診或誤診。兒童鼻咽癌也好發于此，但更多見于咽后壁和頂壁部。