頭孢和阿莫西林同屬于β-內酰胺類藥物，上呼吸道感染時，通常大部分由病毒感染引起，少部分是細菌、支原體、衣原體引起。若合并鼻竇炎、中耳炎等，明確有細菌感染可選用阿莫西林或者頭孢類抗生素。阿莫西林主要針對革蘭氏陽性菌，對革蘭氏陰性菌也有作用。而頭孢分成一代頭孢、二代頭孢、三代和四代頭孢，通常上呼吸道感染時，革蘭氏陽性球菌可能更多，所以通常選一代、二代頭孢即可。但一代、二代頭孢更針對革蘭氏陽性球菌，頭孢三代、四代針對革蘭氏陰性菌作用增強。故兩者兩個作用稍有區別，因為同屬于β-內酰胺類藥物。