患者出現頭痛、腹瀉，可能有以下原因：1、嗜神經病毒感染：患者出現神經炎的時候會引起植物神經功能紊亂，導致出現頭痛、腹瀉；2、腸道病毒感染：迷走神經與痛覺神經相關，誘發頭痛；3、大腦病變：如顱內壓增高、腦積水、腦炎、腦腫瘤、腦梗死、腦出血；4、其他：原發性頭痛、偏頭痛、叢集性頭痛、繼發性頭痛、鼻竇炎、顳動脈炎。