很多人認為顯微鏡是用于觀察細菌、病毒或者微生物，根管治療中使用的顯微鏡是牙科顯微鏡，放大的倍數大概為十幾倍至四十幾倍。根管治療過程中使用顯微鏡的目的是更直觀的觀察根管口的鈣化，再使用顯微鏡把根管口內的情況放大，有些患者的根管口是鈣化的，就必須使用顯微鏡。因為在肉眼下是黑乎乎的，看不清楚，只有使用顯微鏡配合超聲的設備，才能把根管里面的鈣化打通。還有一種情況是有些患者的牙根可能發育的不好，或者根尖炎癥太厲害，導致根尖的封閉已經沒有了，這種情況下也必須使用顯微鏡。因為只有通過顯微鏡直觀觀察根尖孔的情況，才能夠做其他的治療，比如想把根尖孔封閉起來，只有通過顯微鏡，再用一些顯微的器械，把使用的材料準確填送到根尖孔的位置，所以顯微鏡在根管治療中非常必要、非常重要。