腓總神經損傷的治療在早期要盡快進行神經探查修復手術，術后要積極輔助使用消炎、消腫、止痛以及營養神經、抗感染的藥物進行治療。在此基礎上，可進行輔助的針灸、物理治療以及推拿或高壓氧治療等。通過治療，腓總神經損傷的癥狀得到改善或者治愈，則不需要二次治療。如果腓總神經損傷較重，通過上述治療效果不明顯，可以進行二期神經探查修復手術。同時在此期間，也要進行消炎鎮痛、營養神經、高壓氧等治療。針對無法恢復的腓總神經損傷，會遺留有小腿前側肌肉萎縮或者癱瘓癥狀。這種情況下，可以進行踝關節的融合手術，保證患者不會出現足部長期下垂，對患者下地負重活動有一定幫助。