有部分長期慢性反流性食管炎患者，可能會出現吞咽困難，有以下幾個原因：1、胃酸反流：胃酸長期反流侵蝕食管黏膜，就容易形成炎癥，進一步可能形成潰瘍甚至狹窄。如果形成了狹窄，當患者吃飯時，就會有吞咽困難的感覺；2、食管裂孔疝：有部分反流性食管炎患者是由于食管裂孔疝造成，食管裂孔疝就是膈肌變松弛，胃沿著增大的膈肌裂孔進入胸腔內。大概有1/3的反流性食管炎患者真正的原因是食管裂孔疝。由于胃反復地疝入胸腔再滑回，就會影響食管排空功能，在此種影響排空的情況下，患者就會出現吞咽困難。針對這兩個病因，一個是反流，一個是食管裂孔疝，建議還是用通過手術的方法控制反流的因素，就是通常所說的抗反流手術。對于有裂孔疝的患者，應該修補食管裂孔疝，對于食管下端括約肌松弛的患者，要做抗反流活瓣，也就是胃底折疊，來達到控制反流的目的。