原則上女性切除甲狀腺后果和男性沒有區別。甲狀腺功能取決于腺葉切除的多少，如果切除很少一部分，基本不會影響到正常甲狀腺功能。如果切除的部分較多，有可能會影響到甲狀腺功能，出現甲狀腺功能降低等情況。如果完全切除，則失去甲狀腺功能。 甲狀腺要分泌甲狀腺素，以調節人體代謝水平。女性患者切除甲狀腺后，如果發生甲減時，則不容易受孕；受孕以后可能流產；生產以后孩子易患病，如克丁病等，嚴重的可出現智力障礙。所以女性懷孕時一定要告訴醫生，是否曾經患有甲減等疾病。