尖銳濕疣由人類乳頭瘤病毒即HPV毒感染引起，人是HPV病毒唯一的宿主，所以人和人之間的傳播是尖銳濕疣最主要的、唯一的傳播途徑，絕大部分的尖銳濕疣患者通過性傳播引起，當然也有少數的患者因為免疫力極其低下導致HPV感染引起尖銳濕疣，比如腎移植后的患者長期應用免疫抑制藥常常會導致肛周和外生殖器的尖銳濕疣，在臨床上已經遇到過好多例，而且上述患者因為免疫力降低，治療較困難，非常容易復發。另外隨著艾滋病的增多，很多艾滋病患者會伴有尖銳濕疣，治療起來也較困難，非常容易復發。還有其他疾病，因為長期口服免疫抑制劑或激素也有可能引起HPV感染導致尖銳濕疣，但絕大部分的尖銳濕疣是由性傳播引起。