排出僅有黃水的時候可以做腸鏡，當然最佳的情況是到清水，而且最好是不帶糞渣的清水，此時證明腸道準備非常充分且徹底。充分的腸道準備，有助于做腸鏡檢查的時候，清晰地觀察到完整的腸道黏膜，有助于發現病變，避免遺漏。做腸鏡檢查前，常規都要做腸道準備，即要喝洗腸的藥物，現在臨床上比較常用的洗腸藥為復方聚乙二醇電解質散，通過大量地喝水配合藥物，就可以把腸道清洗干凈。良好的腸道準備就是指在進行腸道準備的時候，一定要排到沒有糞滓，最好是清水，部分人排的是帶黃顏色的水，只要沒有明顯的糞渣，都可以進行腸鏡檢查。只有做了良好的腸道準備，腸鏡進去的時候才不會看到糞渣或糞水的殘留，尤其是糞渣覆蓋在腸道的黏膜表面，就會影響對腸黏膜的觀察，可能會導致遺漏病變。