睡眠呼吸暫停低通氣綜合征患者在使用呼吸機過程中，副作用如下：1、這種面罩或者鼻罩的使用，可能會對局部佩戴區域有局部壓迫，可能會引起皮膚的缺血改變，甚至出現潰瘍壞死，所以壓力要選擇合適，只要佩戴部位不漏氣，就達到基本目的，不用扣得特別緊；2、如果漏氣，高流量氣體還可能會造成局部損傷，如果在鼻兩側或者是眼眶下側有氣體泄漏，高速氣流長期刺激眼睛，引起眼部的炎癥，如結膜炎；3、在使用過程中要注意充分的濕化，有的病人會覺得口腔很干燥、鼻腔很干燥，這是另外的副作用。在使用過程中做好充分的濕化，保證濕化器里有充足的水分，并且將濕化的濕化度調高一些；4、還要注意可能還有感染的問題，部分病人長期使用呼吸機可能出現一些肺部的感染，比如曲霉菌的感染，檢查發現呼吸機，會發現管路非常臟，里面有很多污垢，可能有一些真菌，因為呼吸機管道長期處在溫暖濕潤又有氧氣的狀態下，容易滋生細菌、真菌，要做好定期的消毒。