夜間腎臟疼痛的原因具體如下：1、腎臟疾病：如結石、感染等，腎結石患者可以出現嚴重疼痛甚至絞痛，也可表現為較輕疼痛、局部脹痛甚至刺痛等。另外，腎盂腎炎包括急性腎盂腎炎和慢性腎盂腎炎，甚至腎臟結核等，均可導致患者出現夜間腎疼現象；2、腎臟外疼痛：如局部關節、肌肉和筋膜疼痛導致，需先考慮腎臟疾病導致。患者可以進行局部CT或者核磁檢查，根據影像學檢查、尿常規和尿培養檢查，以及明確是否存在固定姿勢時間較久、腰扭傷等情況，判斷夜間腎疼具體原因。