尿道出現細菌感染，需使用敏感抗生素進行抗感染治療以殺滅細菌。尿道外口與外界相通，所以細菌易從尿道外口逆行進入體內，最先進入尿道，所以尿道、膀胱的炎癥較常見。其中以革蘭氏陰性桿菌較為常見，如大腸桿菌等在尿道內定植后，可引起尿道炎。這時可選用能覆蓋上述常見病原體的抗生素治療，如針對革蘭氏陰性桿菌感染，可選擇喹諾酮類抗生素，如左氧氟沙星，還有頭孢類抗生素，包括頭孢呋辛、頭孢克肟、頭孢地尼等第二代、第三代抗生素，能較有效覆蓋革蘭氏陰性桿菌感染。部分患者反復出現感染或出現耐藥性，這時可能需留取尿液做尿培養檢測，再在藥敏試驗指導下選擇敏感抗生素治療。