輸尿管軟鏡取結石手術，其所需時間與結石的負荷量密切相關。對于單發的小結石，如果手術較為順利，有時半小時即可完成手術。如果是多發結石或結石體積較大，手術時間則會大幅度延長，部分患者可延長至1.5小時，甚至2小時，甚至部分患者由于結石體積過大，需進行分期手術。一般手術時間需控制在2小時內，因為手術時間過長，易造成腎盂壓力增高，細菌反流入血液，造成術后高熱。特別是老年人和心血管功能較差的患者，長時間手術，會對心、肺血管系統造成較大創傷和影響，且需重視術后感染現象。過度延長輸尿管軟鏡取結石手術，可能取出更多結石，但也會造成術后恢復不佳的風險。輸尿管軟鏡有創傷小、出血少、恢復速度快等優點，但對于體積較大的結石，由于軟鏡較細，取石速度慢，所以可能需要進行多次，才能將結石取凈。對于較大的鹿角狀結石，可考慮經皮腎鏡取石術等治療方法。