毛果蕓香堿對眼睛有縮瞳作用。毛果蕓香堿最重要的作用是使得瞳孔縮小，讓瞳孔括約肌收縮，在應用此作用時，最初是用來治療青光眼。因為特別是在閉角型的青光眼，房角非常窄，當其發作時，虹膜會堆積在房角，引起房角關閉，使得眼壓居高不下。在此情況下，使用縮瞳的藥物如毛果蕓香堿，使得瞳孔縮小、肌肉變薄，房角處可以扯開。同時毛果蕓香堿還可以使小梁網，也就是房水流出通道，在鞏膜壁上的纖維的網架結構變得空間增大，能夠促進房水外流，所以能夠達到降眼壓的作用。但是單純使用毛果蕓香堿，并不能很好地降低眼壓，特別是在眼壓比較高，青光眼正在發作的時期，需要配合其他降眼壓的藥物同時處理，讓眼壓下來后，瞳孔縮小的作用才能體現出來。青光眼的瞳孔在中大時，是引起眼壓最高的時期。所以只要讓瞳孔避開中大區域，眼壓勢必就可以下降。而眼壓下降后，毛果蕓香堿縮瞳的效果會更加明顯。但目前不主張長期使用毛果蕓香堿，也就是并不希望瞳孔長期處于縮小的狀態。至于何時使用，需要由專業的醫師來決定。