口腔潰瘍，同時伴有扁桃體發炎，具體運用藥物如下：1、中成藥：可以用一些中成的藥物，具有清熱解毒、辛涼解表的藥物，常見的藥物有三黃片、牛黃解毒片、藍芩口服液 、蒲地藍消炎口服液、金銀花軟膠囊、金蓮花軟膠囊、金銀花口服液、西黃丸、芩連丸等等，這些都可以；2、口腔含漱液：如果伴有口腔潰瘍，建議患者進行口腔消毒劑的含漱，可以用康復新液，其具有祛腐生肌的作用，不僅可以含漱，甚至可以進行吞服；3、維生素：除此以外，因為伴有口腔潰瘍，建議服用一些B族維生素，如復合B。對于恢復口腔潰瘍及恢復黏膜功能，有非常好的療效；4、抗生素：如果查血常規提示中性粒細胞，以及白細胞的升高，常常考慮是細菌感染導致。建議用一些抗生素，如青霉素類、頭孢類、喹諾酮類。青霉素類的有阿莫西林、阿莫西林克拉維酸鉀，頭孢類的可以是一代的頭孢氨芐，可以是二代的頭孢克洛、頭孢丙烯、頭孢呋辛等等。如果是18歲以上的患者，且非孕期、非哺乳期、非產期，還可以用喹諾酮類的藥物，如氧氟沙星、左氧氟沙星、拜復樂等。