肛裂通常能夠治愈，治療方法需依據肛裂類型決定，急性肛裂由于創面新鮮，保持大便通暢，經過藥物治療以后可以得到治愈。 慢性肛裂伴有裂痔形成及肛乳頭肥大，時間較長后可伴有肛裂基底部皮下瘺形成，由于局部的炎性組織刺激，較難治愈。此種肛裂必須通過手術治療切除裂痔、肥大肛乳頭以及基底部隱性壞死組織，使創面保持引流通暢，同時切開創面基底部內括約肌。 手術解除引起肛裂難以治愈的兩個因素包括內括約肌痙攣、引流不暢，術后經過局部換藥，創面能夠得到治愈。