指甲起皮、分層有多種原因，具體如下：1、全身性營養不良：包括維生素、微量元素缺乏，嚴重貧血、胃腸道疾病等，導致指甲根部的甲母質細胞功能受到影響，合成甲板蛋白可能出現結構異常，導致指甲出現起皮、分層等異常改變；2、局部因素：比如長期浸泡在水中或者有機溶劑里，導致甲板結構改變，指甲也可以起皮、分層；3、感染因素：比較常見的是皮膚癬菌等真菌感染，甲板發生甲真菌病，稱為甲癬即灰指甲。致病真菌感染甲板后，破壞甲板結構，導致甲板出現起皮、分層、顏色變黃、增厚、破損等現象，可以通過真菌檢查加以明確，而且經過抗真菌治療后，真菌所致的甲板起皮、分層可以緩解。但其他感染比如慢性甲溝炎等，也可以導致指甲出現起皮、分層等現象。