細菌感染時血常規中白細胞和中性粒細胞比例以及絕對值均會升高，而病毒感染時白細胞呈現為正常或減少，淋巴細胞升高。當患者發生肺炎鏈球菌感染導致肺炎時，白細胞和中性粒細胞明顯升高，而麻疹、流行性腮腺炎等病毒感染發生時，白細胞通常正常，但淋巴細胞比例可能出現升高。但上述情況在臨床中并不絕對，也會存在部分例外，如腎綜合征出血熱是由漢坦病毒感染所引起的病毒感染，但患者白細胞卻明顯升高，而由沙門氏菌感染導致的傷寒屬于細菌感染，但患者白細胞卻呈現為減少。因此，區分細菌與病毒感染時單靠血常規遠不夠，其敏感性和特異性均不高，僅作為輔助診斷。盡管多數情況下血常規中白細胞和中性粒細胞升高傾向于細菌感染，而白細胞正常或偏低，同時淋巴細胞升高傾向于病毒感染，但實際并非總是如此。臨床不僅血常規無法區分細菌和病毒性感染，目前應用的感染指標包括血沉、C-反應蛋白、降鈣素原等也均不能絕對區分細菌和病毒感染區別。對于感染類型評估還需結合患者臨床癥狀，以及其他生化指標、影像學檢查、病原體培養等進行綜合評估和判斷。